Ab der vollständigen Inbetriebnahme, die nach Abschluss aller noch ausstehenden Nachbesserungen und Abnahmen für das Jahresende 2024 geplant ist, sollen im Mittel 1.200 Kilogramm grüner Wasserstoff pro Tag erzeugt, auf bis zu 380 bar verdichtet, in Druckgas-Trailer (Lastwägen mit Wasserstoffspeicherflaschen) abgefüllt und verteilt werden. Die Trailer werden den grünen Wasserstoff unter anderem an zwei Bus- und Lkw- Tankstellen in den Landkreisen München und Ebersberg ausliefern, an denen seit 2023 die ersten Wasserstoff- Brennstoffzellenbusse tanken können. Ihren Betrieb im Regionalverkehr der Münchner Verkehrs- und Tarifverbund GmbH (MVV) haben zehn der Busse bereits 2023 aufgenommen. 2024 kamen weitere zwei Busse hinzu. Mit dem verbleibenden grünen Wasserstoff werden außerdem Kunden aus dem Mobilitäts- und Energiebereich versorgt. Ein Teil des grünen Wasserstoffs soll an bestehende und geplante bayerischen Wasserstofftankstellen ausgeliefert werden, um die Dekarbonisierung des Verkehrs in Bayern zu beschleunigen und den Tankstellen-Netzausbau zu unterstützen. Später soll das in direkter Nachbarschaft des Hy2B Elektrolyseurs geplante Wasserstoff Technologie-Anwenderzentrum (WTAZ) mit grünem Wasserstoff beliefert werden. Das WTAZ in Pfeffenhausen, das vom Bund mit bis zu 72,5 Mio. Euro und vom Freistaat Bayern mit mindestens 30 Mio. Euro unterstützt wird, soll als eines von bundesweit vier Wasserstoffzentren das Nationale Innovations- und Technologiezentrum Wasserstoff (ITZ) mitbegründen und soll seinen Betrieb in 2026/27 aufnehmen. 

Der grüne Strom für die grüne Wasserstofferzeugung stammt schon heute zu guten Teilen physikalisch aus der PV-Anlage, die am selben Netzverknüpfungspunkt mit dem Elektrolyseur direkt verbunden wird. Besonders wertvoll wird diese Verbindung, da Pfeffenhausen zu einer Redispatch-Zone (Abregelungszone) für PV-Strom gehört; dies hat zur Folge, dass der in der Solaranlage Burkhart erzeugte PV-Strom an fast jedem Sonnentag bereits vormittags abgeregelt wird. Dabei gehen im Jahr 2024 alleine mehrere Gigawattstunden (GWh) Strom verloren, für die der deutsche Steuerzahler durch Kompensationszahlung aufkommen muss (Deutschlandweit in 2023 mehr als 4 Milliarden Euro). Durch den netzdienlichen Betrieb inklusive Regelenergievermarktung des HyPerformer-Elektrolyseurs in Pfeffenhausen in einem von der BayWa r.e. AG verwalteten Bilanzkreis können mehr als 5 Megawatt PV-Strom auch dann genutzt werden, wenn die PV-Anlage ein Abregelungssignal erhält. Damit wird bisher ungenutzter Strom von mehreren Gigawattstunden nutzbar gemacht und in grünen Wasserstoff sowie zukünftig auch in grüne Wärme und grünen Sauerstoff gewandelt. 

In Summe verhilft der Elektrolyseur zu einer jährlichen Einsparung von mehr als 4.500 Tonnen CO2 in der Modellregion HyBayern und kann in seiner Leistung noch einmal verdoppelt werden (von fünf auf zehn Megawatt), wenn das Wasserstoffzentrum WTAZ zusätzlichen Wasserstoff benötigt. 

Die Entwicklung der Region HyBayern als Wasserstoffregion wird im Rahmen des Nationalen Innovationsprogramms Wasserstoff- und Brennstoffzellentechnologie (NIP2) mit bis zu 20 Mio. Euro durch das Bundesministerium für Digitales und Verkehr gefördert. Die Förderrichtlinie wird von der NOW GmbH koordiniert und durch den Projektträger Jülich (PtJ) umgesetzt.